Есть битриксы, редмайны, кайтоны и т.п. Я понимаю, что этот вопрос уже закрыт множеством продуктов.
Но ни в одном не нашел древовидную структуру требований. Поясню.
Появляется ТЗ в виде хорошего рабочего задания оформленного по всем правилам. Но дальше происходит скатывание в сумбур. Это исправления. И в каждой системе, указанной мной выше, корректировки происходит просто комментариями. Или письмами, или подзадачами.
И появляется хаос, когда нужно собрать все замечания, которые  были связаны с определенным объектом или действием.
По комментариям в коде, но получается на каждый комментарий ты будешь смотреть определенную задачу, а картину в целом не увидишь.
Где можно задачу, со всеми ее замечаниями уложить в какую-то древовидную структуру, чтобы двигаться по ней, а не в куче переписок, комментариев или связанных задач.
В джире видел такой инструмент, как некая вики. Но она появляется уже после завершения проекта, а вот на этапе разработки ничего удобного пока не нашел.

Чем пользуетесь для удобства, накидайте.

СППР

(0) Mind Manager

(0) в Jira можно сделать тип задачи эпик, в нем обычные задачи, в них подзадачи. Сами задачи можно линковать, в них юзерстори и общение. Если в коммите в гите указать номера задач, то автоматизацией код из гита по номеру задачи может подгружаться в Jira и виден в ней. а задачи по объекту видны в его истории/blame в гите