Настроили обычную версию КриптоПро с сертификатом ЭЦП на сервере 1с, ОС Виндовс 8 не серверная, но 1С ее не видит, делали под профилем пользователя службы сервера 1С. Может нужна лицензия серверной Крипто Про?
Разобрались -пользователи были разные у службы и профиля под которым настраивали 1С.
Чтобы обнаруживать ошибки, программист должен иметь ум, которому доставляет удовольствие находить изъяны там, где, казалось, царят красота и совершенство. Фредерик Брукс-младший