Для начала нужно запустить 1С в пакетном режиме . Как это сделать (в режиме Конфигуратора знаю), подскажите в режиме "предприятия". Какой параметр должен быть???
Создай "робота". Пусть при старте запускает свою собственную обработку. Закончит - уходит. А самого "робота" пусть запускает Таск-менеджер. Вот тебе и счастье.