Есть 10 фирм и для них БП3
Есть 1 база ЗУП.

ДАли задание синхронизацию сделать.
Все 10 БП с одним ЗУП.

Как там назначать (вибирать) префиксы?
Для каждой организации префикс уникальный ставлю ведь так.  Наример ЗП ЗУ ЗЕ ЗН итп
А для бухии тоже для каждой свой?   Б1 Б2 Б3  итп ну там или БП БУ БЕ итп

так?
эти префиси на всю базу или только на зарплатные доки???

Нужно различать префиксацию документов и использование префикса в обмене. Вообще не знаю, как так получается, что их путают.

На уровне списка настроенных обменов... там в обработке каждой настройки идет проверка, что не должно повторяться, а что может повторяться. Приемники и источники. Влияют они только на установку уникального имени при обмене через файлы.

Есть еще инфа?

Префикс состоит из 4-х символов. 2 символа - префикс организации, настраивается в справочнике организации. У одной и той же организации в базе ЗУП и БП может совпадать. Даже правильнее, чтобы совпадал. Еще 2 символа - префикс информационной базы. Указывается при настройки синхронизации. Вот этот префикс во всех базах БП и ЗУП должен различаться.