Так ты не сможешь сделать chmod на виндовом диске, сам же понимаешь.
Делай открытие доступа к папке средствами винды. Добавь пользователя для папки, дай ему нужные права. Нужные консольные команды можно выполнять прямо из WSL.
Оптимист верит, что мы живем в лучшем из миров. Пессимист боится, что так оно и есть.