В расширение добавил общий модуль УправлениеДоступомПереопределяемый  и в процедуре ПриЗаполненииПоставляемыхПрофилейГруппДоступа описал профиль по канонам БСП
Обновил вспомогательные данные и все работает великолепно.
Но после обновления конфигурации этот профиль исчезает у пользователя и нужно вручную снова запустить обработку ОбновлениеВспомогательныхДанных
Есть способ чтобы при обновлении типовой конфиги, не слетал профиль?

Странно не должно быть такого.
А профиль новый или типовой?

новый профиль