Здравствуйте. В банковской выписке в поступлении на счет в назначении платежа сумма 1700 в т.ч. услуги банка 50 рублей и формируется одна проводка Д51К76.03 на эту сумму. Но по факту поступило всего 1650. Как можно отделить поступившую сумму на счет от комиссии? Только ручная корректировка проводок в каждом документе?

Проводки формируются согласно сумме в документе, а не по назначению платежа. Выписка из банк-клиента грузилась?

хотите сказать, что в выписке один докумет ?

что за банк ?

(0) Эквайринг? В типовых решениях 1С нет выделения суммы комиссии банка из назначения платежа.
Вариантов несколько:
1. Править руками.
2. Написать свой обработчик.
3. Купить готовое решение, например на инфостарте.

(1) Да из клиент банка
(3) Сбербанк

(4) как это нет?

http://its.1c.ru/db/hoosn#content:442:1cbuh8-3

(4) в последней бух есть вроде.

(7) Точно есть? В описании к релизам не вижу.
В своих базах давно решил эту проблему правилами на основе отборов СКД.