Подскажите как можно с помощью "универсальный подбор и обработка объектов" выбрать всю номенклатуру у которой единица хранения с GUID="значение" заменить на уже существующий элемент справочника с кодом например №1?
Если есть ГУИД объекта, то неважно существует или нет сам объект. Но: я бы предложил "восстановить" объект, ибо далее всё делается штатно. Вплоть до повторного удаления этого объекта, уже "освобождённого" от ссылок.
Чтобы обнаруживать ошибки, программист должен иметь ум, которому доставляет удовольствие находить изъяны там, где, казалось, царят красота и совершенство. Фредерик Брукс-младший