Есть обработка загрузки из excel. И каждый раз при загрузке на определенной строке и в определенном месте вызывается процедура "ОбработчикДействийРезервногоКопирования" из ОМ "РезервноеКопированиеИБКлиентГлобальный" и соответственно обработка перестает выполняться.

Что с этим делать?

файловая?

(1) Клиент-сервер

(0)[Что с этим делать?]
отключать резервное копирование на время загрузки

(3) Но это неправильно, не должен прерываться код каким то фоновым заданием

(0) Прекрати его вызывать

пишите письма в спорлото

(4)[не должен прерываться код]
ну ты это - прострели коду коленку, чё он борзеет

(0) этож сколько по времени длится загрузка?