Переношу остатки и обороты из Бухгалтерии 7.7 в которой очень много счетов, которые бухгалтера создали сами. Стандартными правилами переноса данные счета и остатки не переносятся. Если перепишу правила переноса, чтобы все остатки и счета перенеслись как есть, это чем-то чревато? Просто разговаривал с одним знакомым, он говорил что желательно перед переносам привести остатки и обороты к типовому плану счетов, так ли это?

Зависит от потребностей бизнеса.
Иногда - полезно всё привести к типовому функционалу, чтобы меньше проблем с обновлением.

Бывает, что не всегда целесообразно создавать отдельные счета, например, бухгалтера могут создать отдельный счет для расчета с каким-нибудь крупным контрагентом.

чем проще тем лучше