Отсортировал табличную часть, документ теперь модифицирован... как снять модифицрованность не убирая сортировку табличной части?

никак, док же модифицирован

Записать его

ЗЫ. Ваш Кэп

(2) не надо его записывать, открыли проведенный документ, нажали кнопку "Сортировать", табличная часть отсортировалась и просто закрыть документ без выдачи предупреждения, что его надо сохранять...

(3)  не сортируй

// ну, на тебе гранату:
НачатьТранзакцию(); Записать(); ОтменитьТранзакцию();

Через формекс, там есть метод.

(3) Сортировка, это тоже изменение документа.
Ты меняешь порядок строк в БД.

(5) +100
(7) ему же не надо записывать