"ВЫБРАТЬ            
   |    ТаблицаФакторов.ПроизводственныйФактор КАК ПроизводственныйФактор
   |ПОМЕСТИТЬ втТаблицаФакторов
   |ИЗ
   |    &ТаблицаФакторов КАК ТаблицаФакторов
....
   |    Исследования.Ссылка В
   |            (ВЫБРАТЬ
   |                втТаблицаФакторов.ПроизводственныйФактор.Владелец КАК Приказ
   |            ИЗ
   |                втТаблицаФакторов КАК втТаблицаФакторов)


рабочий код, но конструктор запроса ругается что поле Владелец для втТаблицаФакторов не найдено

если это поле прописать в создании временной таблицы

   "ВЫБРАТЬ            
   |    ТаблицаФакторов.ПроизводственныйФактор.Владелец КАК Владелец,
   |    ТаблицаФакторов.ПроизводственныйФактор КАК ПроизводственныйФактор
   |ПОМЕСТИТЬ втТаблицаФакторов
   |ИЗ
   |    &ТаблицаФакторов КАК ТаблицаФакторов


то получаю ошибку при исполнении запроса - не видит поля "Владелец" у производственного фактора

как быть?

Выразить(ТаблицаФакторов.ПроизводственныйФактор КАК Справочник.ПроизводственныйФактор).Владелец

Конструктор без понятия что у тебя за тип у реквизита ПроизводственныйФактор. Потому либо делай без конструктора - либо перед обращением к провизводным явно вырази нужный тип

это  где - в создании ВТ ?
или при обращении к ВТ
??

(3) В конструкторе, при создании/редактировании ВТ можно указать тип полей.

(4) - только после закрытия конструктор это не сохраняет :)