1с82 на управляемых формах. Есть обработка печати, которая в цикле отправляет на печать документы, и каждый раз появляется окно инициализации. В этот момент пользователь даже почту не может почитать, т.к. это окно появляется и становиться активным, потом соответственно пропадает.

окно в котором выбираеш принтер показывает? обработка кривая значит, так надо бы печатать массово:
ТабличныйДокумент (SpreadsheetDocument)
Напечатать (Print)
Синтаксис:

Напечатать(<ДиалогПечати>)
Параметры:

<ДиалогПечати> (необязательный)

Тип: РежимИспользованияДиалогаПечати.
Определяет необходимость показа диалога печати перед печатью.
Значение по умолчанию: НеИспользовать

Появляется не окно выбора принтера, а инициализации, которое показывает сколько страниц отправлено на печать.
Так как у меня управляемые формы, то окно инициализации появляется как отдельное окно.