Есть внешняя обработка.
она, допустим, обращается к дополнительному источнику данных - несколько таблиц (2-3).

как вы считаете, чем лучше представить эти таблицы?
dbf, xml, txt, что-то еще???

поделитесь собственным опытом, что для вас удобнее?

вот

(4) Ты понимаешь, что этой фразой не ответил не на один из поставленных вопросов? Ответ - ни о чем.
Как собственно и вопрос в (0)...

Мой ответ - хранить в базе данных 1С и не использовать сторонних файлов и таблиц.

А вообще каждый раз решение принимается исходя из множества параметров и критериев (в (2) только часть из них). Плюс с учетом того в чём лучше разбирается программист, который всё это будет писать. У каждой технологии есть свои преимущества и недостатки.