Со сканером бывало, что если тест драйвера не закрыт то при подключении сканера к 1С драйвер ругался, что устройство не готово, или как то тип того.
У АТОЛ-а же платные драйвера может из-за этого...
А у кого ТСД покупали? Я всегда подключаю через CitySoftWarehouseDOS.zip от этого поставщика
http://www.scancity.ru