"Списание товаров может производиться с оптового, розничного склада, а также в НТТ. Списание с оптового и розничного склада производится по себестоимости товаров, рассчитанной на момент оформления документа списания.
При списании товаров в НТТ в графе "Розн. цена" дополнительно указывается та розничная цена, по которой товары будут списываться в НТТ. Розничная цена всегда указывается в валюте бухгалтерского учета."
Связано с тем, что "партионный учет" и зафиксировать себестоимость списания 1С на себя ответственности не берет и правильно делает. Так что только доработка..