В редакторе при выборе цвета можно указать полную прозрачность. Только при попытке заливки таким цветом у меня 8.2 уходила в ступор. Я предпочитаю редактировать и сохранять сразу в png в других редакторах.
(4) Два раза щелкаешь на цвет в палитре. В числовых параметрах есть прозрачность. Выставляешь в 0 (т.е. по логике это наоборот _не_прозрачность, но пофиг).