Задача - каждую ночь запускать удаление помеченных объектов. Хочется это делать не изменяя конфигурацию.
Насколько я понял, это делается с помощью командVB.
Так вот тупой вопрос: а куда надо вставлять этот код, чтобы это запускалось? в батнике не работает

Посмотри в сторону регламентных заданий

так они ж работают только когда база включена

(0) Можешь и через батник выполнять внешнюю обработку при запуске. Описание есть в справке в 1С (параметры командной строки)

/EXECUTE

http://www.nashe1c.ru/materials-view.jsp?id=112

Если база на SQL'е висит, то регламентные задания работают вне зависимости от
запуска её пользователями.

поправочка: вне зависимости от запуска базы пользователями

(0)

Set v81 =  CreateObject("V81.Application")
res = v81.Connect("Srvr = Server;Ref = MyBase;Usr=auto;Pwd=password")
set obr = V81.ExternalDataProcessors.Create("c:\SendFax.epf")

(8) Разврат =)
Простой батник:

c:
cd "C:\Program Files\1cv81\bin\"
1cv8.exe ENTERPRISE /s bases\ut_sql /N USERROBOT /P PASSWORDROBOTA /DisableStartupMessages /UC 222 /Execute "E:\Robozavr\ExtForms\ActualPoint.epf"

(9) Для файлового варианта типа того ... Заметь что Русские (Имя пользователя) символы могут читаться неверно