Посмотрел фильм, потом думал, зачем дети взяли в инопланетный "ковчег" только кроликов, а не каждой твари по паре.

Не они взяли, а им всучили.

а может это чтобы талисманы из кроличьих лапок делать?

фильм не смотрел, фигней не заморачиваюсь...

кроликов дали детям чтобы они [дети] не обос.ались от страха.
по поводу "почему именно дети" - а потому что именно  в этом случае шептунов слышали дети и именно на этом корабле улетели именно дети.
Поскольку старая тетка готовилась к вылету (до смерти своей) а так же учитывая что кораблей были десятки (если не сотни) считаю что на некоторых могли быть взрослые.

+ опять же - дети легче верят в необычные вещи.. взрослый сразу же бы вспомнил картмана и анальный зонд и отказался куда-либо лететь...