Есть табличное поле тпРаботы типа ТаблицаЗначений
В нем сделана колонка Этап у которой Элемент управления Флажок, а тип значения соответственно Булево
При выводе строки естественно поставил  

ОформлениеСтроки.Ячейки.Этап.ОтображатьФлажок = Истина;
ОформлениеСтроки.Ячейки.Этап.ОтображатьТекст = Ложь;

Все выводится красиво
Щелкаю по флажку. Он устанавливается.
Но потом когда пробегаю по таблице

Для Каждого стпРаботы Из тпРаботы Цикл
   Если стпРаботы.Этап Тогда
   ...

Выражение ни для одно строки не срабатывает.
Т.е. хоть флажок и отображается установленным, значение в таблице не устанавливается.

Стал на флажок в конфигураторе. Есть там событие ПриИзменении
Вставил туда процедуру, но она почему-то не отрабатывает...

Книга знаний: Тип реквизита и тип значения
Книга знаний: Размещение колонки с остатками в списке справочника

ты не правильно флажок ищешь. там не просто стпРаботы.Этап.
в отладчике посмотри. делов то.

(2) Посмотрел в отладчике. Все правильно
тпРаботы это табличное поле
Для Каждого получаю строку табличного поля стпРаботы и соответственно
стпРаботы.Этап это и есть колонка табличного поля
В отладчике вижу все колонки и эту тоже и у нее значение ложь

Смотри через ЭлементыФормы.

Для Каждого стпРаботы Из ЭлементыФормы.тпРаботы.Значение Цикл

(4)(5)Для Каждого стпРаботы Из ЭлементыФормы.тпРаботы.Значение Цикл
это та же строка табличного поля
и я отладчиком вижу что стпРаботы.Этап = Ложь
Хотя на экране флажок отмечен

И мне не понятно какое же событие вызывается при смене флажка.

Оказывается на табличном поле есть событие ПриИзмененииФлажка
Событие вызывается, но все равно я не могу отследить состояние флажка
Похоже, что нужно заводить еще одну колонку, куда и писать ПриИзмененииФлажка...

че то ты намудрил с флажками. при чем тут событие. а ты сможешь .CF куданить выложить? так... для общего развития...

Особо ничего выложить сразу не получится
Это таблица на форме документа, который вводится на основании другого документа
Конечно все можно запихнуть во внешнюю обработку, но похоже сам интерфейсный элемент не хранит данных и вся обработка должна производится в ПриИзмененииФлажка

Нашел Пример 1. Отметка строк в табличном поле, связанном с таблицей значений
Основные принципы реализации этой возможности следующие:
1. Список отмеченных строк нужно хранить, например, в коллекции типа "Соответствие".
2. Текущее состояние флажков нужно отображать с помощью обработчика события ПриВыводеСтроки.
3. Отслеживать переключение флажка и соответствующим образом изменять коллекцию в обработчике события "ПриИзмененииФлажка".

(9) Колонка - только у табличного поля или есть и в той таблице значений, которая отображается в этом табличном поле?
Что указано в качестве данных для той колонки, в которой ты создаёшь флажок?

Если в _таблице значений_ колонки Флажок нет - заведи её, и отображай в нужной колонке.