Чем отличается передача параметров в функцию по ссылке от передаче по значению?

По ссылке у тебя значение меняться будет и в месте вызова. А по значению - нет.

(1) Такая трактовка справедлива только для примитивных типов (строка, число и т.д.). Для агрегатных типов справедливо такое уточнение: при передаче по значению невозможно изменить ссылку на объект, переданный в параметре. Другими словами, если передана ТЗ "по значению", то вернуть другую ТЗ в вызывающую функцию невозможно, а очистить ТЗ не составит никаких проблем.

А как это в v8 различается передача по ссылке или по значению?

см синтаксис - там есть квалификатор типа Знач