В том виде, в котором оно представлено при выборе папки в поле ввода с режимом "Группы".
Запрос
"ВЫБРАТЬ
|    Номенклатура.Ссылка КАК Папка
|ИЗ
|    Справочник.Номенклатура КАК Номенклатура
|ГДЕ
|    Номенклатура.ЭтоГруппа = ИСТИНА
|ИТОГИ ПО
|    Папка ТОЛЬКО ИЕРАРХИЯ"

и последующая его выгрузка в дерево дают какую-то галиматью. Папки задвоены. Одна и та же папка может быть на первом уровне и на втором.

Существует форма выбора группы, она все сама выводит.

Точно, фенькс!