Разница есть при заполнении декларации по НДС. При применении расчетной ставки (20/120, 18/118 и т.д.) налоговой базой является сумма, включающая НДС, в то время как при обычной ставке базой является сумма без НДС.
TurboConf — расширение возможностей Конфигуратора 1С