У одного пользователя выполняется вход 10 минут

Для начала кеш и настройки пользователя вычистить.
А потом сравнить конфигурации, чем отличаются

Может, в тестовой галка использования РЛС отключена, или ещё что.

замер производительности не помешает, возможно так будет быстрее найти проблемное место

(0) Поди когда под полными правами входите кресло не подвигаете к столу, а когда пользователь под собой входит кресло к столу подвигаете?

(0) Может какой нить модуль подключен, который при запуске системы пытается запуститься, но не может (простые звонки и т.д.)

(0) Запусти в отладке и посмотри какой кусок кода забирает столько времени

(7) Интернет поддержка при входе в инет лезет?

А кроме того, чтоб прийти на Мисту, какие действия-манипуляции уже применили к этому случаю?

Если в тестовой такого нет...

Я бы по максимуму создал на компе этого пользователя еще одно подключение к базе к пускаче.
Создал бы в самой базе еще одного нового дубль-пользователя, но с нужными правами. И посмотрел, поможет это или нет.

Это не займет большого времени и это похоже на шаманство, но иногда работает. Особенно, когда не слишком много свободного времени и нет физического доступа к компу пользователя.

(11) процент считается не по сотруднику, а по пользователю?

замер производительности что говорит?

(11) Ну вот. Это уже другое дело. Перепривяжи нового пользователя БД, к старому пользователю в справочнике. Это будет быстрее.

(0) может комп дохнет

(11) А не надо заходить "с этого же пользователя"

Я не советовал тебе получить результат "та же фигня", поскольку такую же фигню сам получал много раз.

Именно тот вариант, что можно создать другого пользователя и с ним работать.
Я не знаю от каких там физических причин это приключается. Но на практике такое приключается. Обычно лечить приходится вот так.

Хочешь и есть желания и возможности искать корни? А пользователь тоже будет курить бамбук, пока ты исследовательскую работу выполнишь?

з.ы. Самое противное в этой ситуации, что такое происходит уже не в первый раз. Однозначного ответа нет на "а что же там ломается"
з.з.ы. Никого не хотел обидеть манерой изложения, если что

(16) В отладчике посмотри как они привязываются. Скорее всего по GUID пользователя ИБ (реквизит ИдентификаторПользователяИБ). Пользователю из справочника, в реквизит ИдентификаторПользователяИБ запиши GUID пользователя ИБ.

что бы могло значить игнорирование автором совета по замеру производительности?

(0) У пользователя при старте какие-нить динамические списки отображаются? Ну там рабочий стол какой-нить?

(0) ТИИ сделайте

(16) перепривязать - зависит от того, какая конфигурация. На свежих БСП есть такая возможность.
---
Пользователи информационной базы
Список предназначен для удобства согласования пользователей ИБ в Конфигураторе со списками Пользователи и Внешние пользователи.

Список можно открыть по команде Еще - Пользователи информационной базы в меню списка пользователей (или внешних пользователей).

При записи пользователя (или внешнего пользователя) вместе с ним автоматически создается или изменяется соответствующий ему пользователь ИБ. Однако есть ряд ситуаций, когда список пользователей ИБ становится несогласованным со списком пользователей. Тогда с помощью данного списка могут быть решены следующие задачи:
---
это копипаста из встроенной справки БП3